إِذْ: ظرف زمان

ناداهُ رَبُّهُ: ماض ومفعوله وفاعله والجملة في محل جر بالإضافة

بِالْوادِ: متعلقان بمحذوف حال

الْمُقَدَّسِ: صفة

طُوىً: بدل من الوادي.