وَقَوْلِهِمْ: عطف على قولهم قبلها
إِنَّا قَتَلْنَا الْمَسِيحَ: إن ونا اسمها والجملة الفعلية بعدها خبرها
جملة «إِنَّا» مقول القول
عِيسَى: بدل من المسيح
ابْنَ: صفة أو بدل من عيسى
مَرْيَمَ: مضاف إليه مجرور بالفتحة للعلمية وللتأنيث
رَسُولَ اللَّهِ: بدل من المسيح أو صفة الله لفظ الجلالة الله مضاف إليه
وَما قَتَلُوهُ: فعل ماض والواو فاعل والهاء مفعول به والجملة حالية وما نافية
وَما صَلَبُوهُ: عطف
وَلكِنْ شُبِّهَ لَهُمْ: الجار والمجرور متعلقان بالفعل الماضي المبني للمجهول قبلهما ونائب الفاعل مستتر ولكن حرف استدراك والجملة معطوفة.
وَإِنَّ الَّذِينَ اخْتَلَفُوا فِيهِ: إن واسم الموصول اسمها والجملة صلة الموصول وفيه متعلقان باختلفوا والجملة مستأنفة
لَفِي شَكٍّ مِنْهُ: اللام هي المزحلقة والجار والمجرور بعدها متعلقان بمحذوف خبر إن ومنه متعلقان بشك
ما لَهُمْ بِهِ مِنْ عِلْمٍ: لهم متعلقان بمحذوف خبر مقدم به متعلقان بعلم من حرف جر زائد وعلم اسم مجرور لفظا مرفوع محلا على أنه مبتدأ
إِلَّا: أداة استثناء
اتِّباعَ: مستثنى منقطع منصوب
الظَّنِّ: مضاف إليه والجملة مستأنفة.
وَما قَتَلُوهُ يَقِيناً: ما نافية وفعل ماض وفاعل ومفعول به ويقينا حال منصوبة والجملة معطوفة.